Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MRTO4Q9UKD2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms