Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms