Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFMBT1Q9UHJ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms