Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX1-2Q9UD57 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms