Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APEX2Q9UBZ4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APEX2Q9UBZ4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms