Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DBF4Q9UBU7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DBF4Q9UBU7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms