Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP2BPQ9P2M1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP2BPQ9P2M1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms