Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCMF1Q9P0J7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms