Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZDHHC3Q9NYG2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms