Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms