Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms