Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBRD1Q9NUN5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBRD1Q9NUN5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms