Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms