Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP3Q9NS15 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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