Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms