Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLE3Q9NRF9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms