Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DUOX2Q9NRD8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX2Q9NRD8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms