Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCM1Q9NP62 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms