Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LGR6Q9HBX8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGR6Q9HBX8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms