Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLSPNQ9HAW4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms