Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms