Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLMPQ9H6B4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms