Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms