Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms