Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4CQ9C0C4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms