Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KATNB1Q9BVA0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KATNB1Q9BVA0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms