Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms