Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TINF2Q9BSI4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TINF2Q9BSI4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms