Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms