Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms