Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX2Q99697 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms