Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms