Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HHIPQ96QV1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHIPQ96QV1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms