Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3IPQ96QF0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms