Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms