Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00208Q96KT6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms