Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS50Q96JG6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms