Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms