Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEO1Q92859 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEO1Q92859 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms