Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms