Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSMEM1Q8WWF3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms