Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSH3Q8TE77 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSH3Q8TE77 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms