Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC24Q8N4L8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms