Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms