Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC18Q8N456 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC18Q8N456 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms