Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC2Q8N158 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms