Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CMTM1Q8IZ96 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM1Q8IZ96 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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