Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms