Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms