Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms